消化内科分中心以食管、胃肠及肝胆胰腺疾病的内镜介入(微创)诊断与治疗为特色，国内领先、国际知名。在消化系疑难病及肿瘤的发病机制、早期诊断和治疗方面不断创新、突破，多次承担国家“十一•五”支撑计划、“863”计划、国家自然科学基金、卫生部公益性项目、国家科技部之国际合作项目、“九•五”攻关项目、北京市科委重点科研项目。每年与中国医师协会消化医师协会共同主办“北京国际消化疾病论坛”、承办卫生部委托的 “全国消化医师进修班”，同时不定期举办不同层次的胃镜、结肠镜、EUS、ERCP沙龙及“手把手”培训班，“‘友谊’消化直通车万里行”被批准为“卫生部第二轮十年百项计划”，学员们在经过“手把手”的培训后，临床技能有了长足的进步，为带动发展边远、基层的医疗卫生机构做出了一定的贡献。定期举办“一带一路高级消化内镜国际大讲堂”， 推动了“一带一路”沿线国家消化内镜整体水平的提升，建立了互助纽带和长期的学术交流中心，提高了我国在消化领域的国际影响力，所在内镜中心被世界内镜组织WEO评为“全球最佳内镜中心”之一。近5年，承担国家科技部重大专项等国家级科研项目19项，“十四五重点”健康专题1项，发表SCI论文135余篇。牵头、参与制定临床指南及专家共识13部。