呼吸内科创建于1972年，起初为呼吸疾病专业组，1994年正式成立呼吸内科。目前是北京市临床重点专科，国家PCCM规范化建设项目优秀单位，国家药物临床试验机构，也是北京市三甲综合医院中规模大、专业技术水平强、开展专业领域全面的呼吸科之一。

截至2025年，呼吸内科在西城、通州、顺义三个院区共有病床91张，设立呼吸监护室、肺功能室、气管镜室、睡眠监测室等。科室共有医师30人，其中主任医师7人，副主任医师5人，全部在省级以上学术团体任职。博士生导师3人，硕士生导师1人，多位医生先后在国外进修研习。

科室在呼吸系统疾病的诊断、鉴别诊断和治疗方面有极丰富的临床经验，其中慢性阻塞性肺疾病和心肺运动生理的研究达到国内先进水平。2025年，科室荣获国家PCCM慢阻肺病专病“示范单位”称号。科室拥有先进、齐全的医疗设备，是国内较早建立肺功能室、睡眠监测室、支气管镜室的科室之一。2023年以来，已开展经皮穿刺肺肿物消融术100余例，该技术具有“创伤小、并发症少、恢复快、疗效确切”的特点。另外，气管镜下冷冻、电切、激光、氩气刀以及超声内镜下纵隔淋巴结穿刺、硬质气管镜下支架置入、肿物电切、异物取出等介入操作常规开展。科室还开展了经电磁导航下肺外周病灶精准定位与诊疗，为广大肺结节患者提供更安全、高效、微创的诊疗选择。

科室是北京市住院医师规范化培训基地，首都医科大学呼吸病学系博士研究生培养点，同时拥有博士后合作导师1人，承担医学/护理实习生、住院规范培训医生、进修医生、硕士及博士研究生的教学工作。近年来，科室主持完成了国家自然科学基金5项，省部级临床和基础课题共20余项，承担临床药物试验20余项，发表SCI文章及核心期刊文章150余篇。